Velo Dunajec przebiega przez tereny Pienin, Tatr i Beskidów. Biegnie wzdłuż Dunajca, Jeziora Czorsztyńskiego, przez teren Pienińskiego Parku Narodowego oraz Sądeckiego Parku Etnograficznego. Jadąc trasą Velo Dunajec odwiedzimy między innymi: Zakopane, Nowy Targ, Niedzicę, Sromowce, Szczawnicę, Krościenko, Łącko, Stary i Nowy Sącz, Rożnów, Czchów, Biskupice, Ostrów, Wietrzychowice.

Z Niedzicy do Czerwonego Klasztoru na granicy polsko-słowackiej jest zaledwie około dwunastu kilometrów, a kolejne tyle dzieli Czerwony Klasztor od Szczawnicy jadąc słynnym przełomem Dunajca. W drugą stronę z Niedzicy można dojechać do Dębna a następnie Nowego Targu czy Zakopanego